La biblioteca de la Fundación Francisco Ayala está abierta al público investigador de lunes a viernes, de 9 a 14 horas.
Obras de Francisco Ayala
La Fundación dispone de numerosas primeras ediciones de los libros publicados por Ayala, algunos de ellos editados en los años veinte y treinta o en Hispanoamérica y hoy inencontrables, así como de otras muchas ediciones de aquellos títulos que las han tenido. Además de las primeras ediciones de La cabeza del cordero, Muertes de perro o Historia de la libertad, forman parte de los fondos de la biblioteca antologías, libros colectivos y revistas que contienen textos del autor o en cuya edición participó.
Obras sobre Francisco Ayala
Entre los fondos de la biblioteca ocupan también un lugar destacado monografías, ensayos, libros colectivos u obras de referencia que están dedicados por entero a Ayala o que contienen textos sobre él. Con la colaboración del Ministerio de Cultura, la Fundación ha desarrollado una exhaustiva bibliografía pasiva de Francisco Ayala a partir de esos fondos propios. Para realizar consultas bibliográficas, puede escribir a biblioteca [arroba] ffayala.es

Libros de Francisco Ayala
Enriquecen la biblioteca de la Fundación los volúmenes más valiosos de la colección personal de Francisco Ayala, muchos de los cuales contienen dedicatorias autógrafas de los autores, a los que Ayala conoció personalmente o con los que tuvo amistad. Puede leerse una descripción de esos fondos en la sección Los libros de Ayala.
Otros libros
Con la intención de abarcar un ámbito al menos tan extenso como el de la propia vida de Francisco Ayala, la biblioteca de la Fundación se nutre también de libros de literatura y ensayo del siglo XX y contemporáneos, especialmente de los temas que más cercanos resultan a los que ocuparon la vida y la obra del autor: ensayo sociológico, literatura del exilio e historia intelectual.
Biblioteca de Enrique Molina Campos
La Fundación Francisco Ayala alberga la biblioteca que perteneció al poeta y profesor Enrique Molina Campos (Málaga, 1930-1994) y a Rosario Moreno, quien la donó a la Fundación. Esta colección está compuesta básicamente por literatura del siglo XX, y en especial por poesía: excelentes selecciones de editoriales como Hiperión, Visor, Barral, Lumen o Tusquets forman parte de ella, así como ediciones malagueñas de poesía en cuadernos o plaquettes.
Hemeroteca
La biblioteca de la Fundación dispone de una extensa colección de recortes de prensa relacionados con Ayala: artículos, reportajes, noticias y sueltos, desde el año 2003. Asimismo, se cuenta con las colecciones completas de los textos publicados por el autor en los diarios ABC y El País.

Archivo
Uno de los cometidos de la Fundación es la conservación de aquellos documentos personales de Francisco Ayala que puedan resultar de interés para el conocimiento de su obra o de su figura en general. En la Fundación se custodia correspondencia, títulos, acreditaciones, contratos editoriales y otros documentos, que pueden ser consultados en sus dependencias.
Fotografías
La Fundación dispone de una nutrida colección de fotografías de Francisco Ayala y de sus familiares y amigos, de los lugares donde residió o los que visitó, así como otras de época, en diferentes formatos, algunas de las cuales se encuentran expuestas en el palacete. Además, está a disposición del público investigador un extenso catálogo de imágenes en formato digital compuesto por más de mil registros.
Audiovisuales
La Fundación tiene también entre sus fondos una interesante colección de material audiovisual compuesta por entrevistas e intervenciones de Ayala en radio y televisión, documentales sobre él, programas especiales con motivo del centenario o de otras efemérides, así como grabaciones de actos públicos protagonizados por el autor: nombramientos, concesiones de premios, investiduras, etcétera.